Les maladies infectieuses sont très nombreuses. ll y a aussi d'autres maladies qui peuvent être dues indirectement à des bactéries et virus (HPV p.ex).
Antibiotiques[]
Mais attention, il y a aussi des résistances aux antibiotiques. Les antibiotiques ont permis de transformer la médecine (transplantation p.ex). Les résistances antibiotiques (autrement dit les bactéries résistantes) sont transportés par les gens qui voyagent. Ceci cause un problème car on doit trouver des nouveaux médicament qui sont plus forts, mais dont les effets secondaires sont aussi plus forts.
Bactériologie[]
Seul une petite partie des bactéries sont pathogènes. Il y en a beaucoup et partout. Cet équilibre entre les micro-organismes et nous est nécessaire.
Réservoir[]
Eau, air, nourriture, animal, personne infectée.
Pathogèneendogène: flore normale, opportuniste
Pathogèneexogène: micro-organistes normalement pas présents dans le corps humain.
On a plus 10x plus de bactéries que de cellules. En effet, environ 10% du métabolite dans le sang sont dues aux bactéries. De plus il y a des différences entre les gens dans la flore bactérienne.
bactéries intestin
La flore normale est nécessaire pour la digestion (il y en a beaucoup dans le colon). On en a besoin comme protection (compétition) et pour digérer. Finalement les bactéries stimulent le système immunitaire.
Les antibiotiques affaiblissent la flore bactérienne normale et le clostridium difficile se propage et fait que les patients ont des diarrhées.
Infection[]
- Colonisation: présence du micro-organisme sans réaction de l'hôte
- Infection: présence de pathogène avec réaction de l'hôte
- Maladie: changement de l'état normal de l'hôte
Sites stériles[]
urine
articulation
LCR
Sang
Tissus profonds
Les bactéries[]
Procaryote
Relativement petits (retenus par filtre à eau)
N'ont pas de noyau
N'ont pas d'organelles
Se divisent rapidement (30min)
On peut les filtrer
Possèdent 1 ou 2 chromosomes (souvent circulaires)
Ont entre 600 et 5'000 gènes
Ont une paroirigide (le peptidoglycan)
Possèdent 1 ou 2 membranes
On en trouve 10^30 sur terre, 10^14 sur nous (contre 10^13 cellules)
Peu sont des pathogènes
facteurs de virulence
Celles qui sont des pathogènes possèdent des facteursdevirulences
protéinesde surface ou pili/fimbriae pour adhérer à des surfaces pour pouvoir entrer et adhérer.
Pour se multiplier il faut s'adapter à la température ou à l'acidité, capter le fer, trouver une niche (p.ex aérobe ou anaérobe)
Pour échaper au système immunitaire: se rendre invisible, inactiver le complément, changer les antigpnes de surface, inactiver les anticorps, ne pas se laisser manger (ne pas laisser les anticorps se fixer), s'attaquer au système immunitaire
Ont des pili qui sont longs longs (ou fimbriae - courts) qui peuvent être contractiles et peuvent être exprimés suivant les conditions. Les fimbriae/pili permettent la conjugaison ce qui permet aux bactéries de se rapporcher. Pour adhérer, la cellule injecte ses propres récepteurs dans la cellule, ce qui modifie le cytosquelette de la membrane pour pouvoir rentrer dans la cellule.
Ont des flagelles
Sont aérobes ou anaérobes
Sont extracellulaires ou intracellulaires (moins accessible pour les antibiotiques et pour le système immunitaire)
Peuvent être opportunistes: ils sont toujours présents et peuvent faire une maladie lors d'une faiblesse de l'hôte.
Peuvent echanger leur ADN par conjugaison (transfert par contact direct), transduction (transfert par erreur par un phage) ou transformation (incorporation d'un ADN de l'environnement - certaines bactéries sont compétentes pour capturer l'ADN). Ainsi, leur génome est très variable.
Peuvent nour rendre malade (réaction inflammatoire en réponse à des PAMPs, production de toxines, entrée dans les cellules et destruction cellulaire.
Exemple de bactérie[]
Listeria: Bactéries de l'environnemnet, pousse très bien à faible température, très dangereuse pour les femmes enceintes et les personnes immunosupprimées.
Borrelia:Pathogène de la maladie de Lyme, transmis par les tiques
Escherichia Coli: Différentes souches peuvent faire des pyélonéphrites et cystites.
Enveloppes bactériennes[]
procaryote vs eucaryote
Les bactéries sont des procaryotes: 10-20μm. Elles ont une enveloppe.
L'enveloppe de la cellule est très importante: C'est la première structure vue par le système immunitaire. Elle peut être adhérente (pili, protéines de surface) et mobile (flagelle). Elle peut avoir une capsule.
Le mimétisme moléculaire leur permet d'échaper au système immunitaire de l'hôte.
L'enveloppe permet une perméabilité (nutrition) et protection (contre des toxines et notamment antibiotiques)
Finalement l'enveloppe permet d'identifier et classifier les bactéries.
Enveloppe[]
enveloppes
toutes les bactéries ont une première membranebi-lipidique
en-dessus se trouve une couche de peptidoglycan formant la paroi, épaisse chez les Gram+, fine chez les Gram-
en-dessus se trouve seulement chez les Gram- une seconde membranebi-lipidique, avec le LPS
en-dessus peut se trouver de manière facultative une capsule (de sucres généralement)
l'enveloppe a proprement parler comprend la paroi, la seconde couche et la capsule. Mais pas la première couche
membrane cellulaire
Membranes bi-lipidiques bactériennes[]
toujours présente
bi-couche de phospholipides
mais pas de cholesterol
contient des protéines de transports, canaux, etc.
point d'ancrage pour les pili ou flagelle
Parois Gram+[]
paroi Gram+
Paroi plus épaisse que les Gram-
Elle est formée par le Peptidoglycan (peptides et sucres) avec des acides lipoteichoid ou techiod.
Le Peptidoglycan est une chaine de NAG et de NAM liés par des ponts peptidiques. Ceci donne la structure de la cellule.
Les ponts peptidiques (tentrapeptides, pentapeptides) peuvent se faire casser par la Lysozyme (on en a dans la salive)
A la surface du peptidoglycan se trouvent des protéines de surfaces
Les structures sont synthétisées dans le cytosol, transportées par un transporteur spécifique, puis assemblées dans la paroi
Deux enzymes sont responsables de ces mecanismes (assembler la paroi): la glycosidase pour ouvrir la paroi, et la transpeptidase pour former les liens après l'insertion
L'Acide Sialique (de l'hôte) ajouté sur le LOS des Neisseria Meningitidis empêche sa reconaissance
Mimétisme moléculaire (Mimicry)[]
Le camouflage implique que la structure de la bactérie soit la même qu'une structure humaine, ce qui fait qu'elle ne se fait pas détecter (comme l'acide sialique sur la capsule de Nesseria Meningiditis qui est le même que sur les cellules neuronales. On peut pas faire de vaccin contre le type B qui est celui qui a l'acide sialique)
La ressemblance implique que la structure de la bactérie soit presque la même qu'une structure humaine. Elle se fait détecter et induit une réponse, mais la réponse détruit aussi les composés humains qui lui ressemblent (comme certaines protéines M de streptococcus pyogenes qui ressemblent à la myosine cardiaque).
Antibiotiques[]
Les enveloppes cellulaires (Gram - surtout) ont une faible perméabilité aux molécules hydrophobes
Les petites molécules hydrophiles (taille des sucres, acides aminés) peuvent entrer, via les porines (gram -)
Les parois sont des cibles d'antibiotiques (le β-lactame inhibe la transpeptidase qui fait la synthèse de peptidoglycans)
La bactérie peut développer des résistances (sécrétion de β-lactamase - dégrade les pénicillines, pompes à efflux - rejette l'antibiotique à la surface, peut inhiber la porine - empêhce l'antibiotique d'entrer dans les gram -)
Glycopeptides: inhibe l'élongation du peptidoglycan
Spores[]
Cellule en veille (enveloppe + une copie des chromosomes)
Très résistants à l'environnement
Dissémination très efficace
Nommenclature[]
Binomiale (genre-espece): Escherichia-Coli
Selon la morphologie: Staphyloccoque Doré
Selon la maladie: Myobacterium Tuberculosis, Vibrio Cholerae
Selon le scientifique: Theodor Escherich
Coloration de Gram[]
coloration de Gram
On colore au violet gentiante
On fixe par le lugol(fixe le colorant)
On décolore à l'acétone/alcool
On re-colore à la fuschine
Une bactérie Gram+ aura fixé le violet gentiane sur son peptidoglycan, restant de cette couleur (Gram + est bleu-violet)
Une bactérie Gram- aura décoloré à l'acétone, et sera colorée en rose par la fuschine (Gram - est rose)
Formes[]
formes
Coques: des sphères, comme des grappes de raisins
Bacilles: des batônnets
Spiralées (spirochètes): en spirales
La forme n'indique en rien le fait d'être Gram+ ou Gram-
Il existe d'autres colorations que la coloration Gram: la coloration orange citrine (plus sensible et moins spécifique => intercalé dans l'ADN et fluorescent), Ziehl-Nissen pour les mycobactéries (tuberculose).
Identification au labo[]
Prélèvements sites stériles (sang, LCR) ou non (frottis gorge, sputum , plaies, selles)
Problème: distinguer la flore du pathogène
30min-8h: Examen direct du spectum ou autre (coloration, sérologie, PCR)
18-24h: Isolement (culture - pour les streptocoques, on regarde avec la gélose au sang leur capacité d'hémolyse)
<24h: Tests biochimiques (agglutination, catalase, spectrométrie d'une colonie)
<30h: antibiogramme (savoir si la souche est susceptible, résistante ou intermédiaire à un antibiotique)
